¿Cuáles serán los resultados de RACE y RTPCR?

RACE es la secuencia intermedia de un ARN conocido, por lo que los extremos 3’ y 5’ se amplifican mediante PCR a través de la secuencia conocida y una secuencia de conexión artificial específica (fragmento de ARN sintético), y luego se secuencian. para obtener la longitud completa. Aquí hay una foto.

http://thunder .BIOS ci .umbc .edu/classes/biol 414/spring 2007/index

RT-PCR primera transcripción inversa de ARN en ADNc. y luego hacer PCR. No es necesario que lo haga en toda su longitud. Puede ser cualquier párrafo intermedio. Depende de la ubicación de la imprimación.

Respuesta complementaria:

Además, ¿RACE suele diseñar cebadores a partir de secuencias homólogas en ambos lados del ARNm? ¿Qué debo hacer si la secuencia conservada no está en ninguno de los lados? ¿Amplifica las secuencias de los extremos 3' y 5' [desde el medio], las secuencia y las empalma, luego diseña cebadores y realiza la PCR nuevamente? ¿Entonces lo que obtienes es un ADNc completo?

Los cebadores de ambos lados de RACE están diseñados en base a fragmentos de ARN conectados artificialmente. No es una secuencia conservada.

Dado que la RT-PCR no necesariamente puede obtener la longitud completa, ¿para qué se utilizan habitualmente los fragmentos?

1. Compruebe si el gen se expresa. 2. Comparar niveles de expresión (como PCR cuantitativa en tiempo real)

¿Existen similitudes entre los cebadores diseñados por RACE y RT-PCR?

En un par de cebadores RACE, el propio ADNc tiene una sola secuencia y suele estar situada al final. La RT-PCR, que se dirige a secuencias de ADNc, a menudo tiene al menos una región de unión intrón que necesita atravesar el exterior. Generalmente no hay similitudes.

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