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Cómo encontrar el CDS del gen objetivo en NCBI

Cómo encontrar el CDS del gen objetivo en NCBI

Encuentre el grupo de genes de varias especies estrechamente relacionadas, encuentre varias regiones conservadas con una longitud superior a 20, extraiga algunos cebadores en estas regiones conservadas y colóquelos en primer5 para calificar. Encuentre un par de cebadores que obtengan una buena puntuación. La longitud del producto puede ser de 200 a 1000 pb, simplemente amplíela. Si no se puede encontrar exactamente el mismo cebador, está diseñado para degenerarse en bases diferentes.

Si conoces el nombre del gen que estás buscando, podrás encontrar rápidamente la secuencia que buscas, simplemente ingrésala en la interfaz de búsqueda de nombres de genes. Debido a que todos los genomas enviados al NCBI pueden predecir CDS, todos indican la posible función de cada CDS y el nombre de la proteína o enzima correspondiente. Si no conoce el nombre del gen, puede juzgarlo comparándolo y probar BIOED.

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