Las características topográficas de Japón varían de altas a bajas.
Las características del terreno de Japón son: alto y montañoso en el medio; bajo y plano por todos lados. Aproximadamente el 61% del territorio de Japón es montañoso con una altitud de más de 300 metros. 18 son colinas por debajo de los 300 metros sobre el nivel del mar, que en conjunto representan casi el 80% del país. Hay 21 montañas por encima de los 3.000 metros sobre el nivel del mar. El más alto de ellos es el Monte Fuji en las prefecturas de Yamanashi y Shizuoka, con una altitud de 3.776 metros. Los lugares más bajos son las nuevas llanuras de Yokohama, Kawasaki y Kanagawa. Debido a que Japón está ubicado en el límite de desaparición de la placa euroasiática y la placa del Pacífico, es decir, el Anillo de Fuego y la Zona Sísmica del Pacífico, que es parte de la combinación del arco insular del Pacífico occidental, la costa montañas y trincheras, son frecuentes las actividades volcánicas y sísmicas. El 68% del país es montañoso y una décima parte de los volcanes del mundo se encuentran en Japón.